En el ámbito académico, Carlos Martínez Muñoz ha sido profesor mentor en la ETSAM-UPM (Madrid) en la Unidad Garrido P5 (Ginés Garrido Colmenero) y Unidad Espegel P1 (Carmen Espegel) del 2018 al 2019. Ha sido profesor en la Universidad Científica del Sur (UCSUR) entre 2020 y 2022 en los cursos de Talleres de Diseño, Investigación y Diseño Urbano, conferencista en la Municipalidad de Lima, profesor invitado de la Universidade Presbiteriana Mackenzie de Sao Paulo y en la Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) de Brasil. Actualmente, combina la práctica de su despacho con la enseñanza, desempeñándose como profesor principal en Lima, en la Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas (UPC) en la cátedra de Talleres de diseño VII - VIII y de la asignatura de Metodología de investigación.